Fue uno de los fundadores y primer Director General del Banco Central de la República Argentina (1935-1943). Posteriormente de su retiro del Banco Central, el Dr. Prebisch se dedicó a la investigación y a la tarea universitaria de 1943 a 1948.

Luego de una breve estadía en el Banco Central del México, ingresó como Secretario de la Comisión Económica para América Latina de las Naciones Unidas y fue designado Secretario Ejecutivo de la CEPAL en 1950, cargo que desempeñó hasta 1963, al cual renunció para hacerse cargo de la Secretaría General de la Conferencia de las Naciones Unidas sobre Comercio y Desarrollo, UNCTAD, por su designación del entonces Secretario  General de las Naciones Unidas,  U. Thant. Mientras tanto en 1955, Prebisch fue designado en su antigua cátedra de Economía Política en la UBA, en forma honoraria. Fue también miembro honorario de la Facultad de Economía de la Universidad de Chile y de las Universidades de San Andrés, La Paz (Bolivia) y de San Marcos, Lima (Perú). Le fue conferido el título de Doctor Honoris Causa por la universidad de Columbia University, Nueva York; Universidad de Los Andes, Bogotá; Universidad de Punjab, India;  Universidad de Montevideo, Uruguay; Bar Ilan, Israel; Complutense, España y Edimburgo, Escocia.

En 1962, mayo, fue designado Director General del Instituto Latinoamericano de Planificación y Desarrollo Económico y Social, ILPES, establecido en Santiago de Chile bajo la égida de la Comisión Económica de América Latina de las Naciones Unidas, y con asistencia financiera del Fondo Especial de las Naciones Unidas y el Banco Interamericano de Desarrollo.

En julio de 1962 el Dr. Asistió a la Conferencia sobre Problemas de Desarrollo Económico, en el Cairo, lo hizo en carácter de observación por las Naciones Unidas.

El 10 de febrero de 1965 la Asamblea General  confirmó en forma unánime la designación del Dr. Raúl Prebisch como Secretario General de la Conferencia sobre el Comercio y Desarrollo de las Naciones Unidas.

En 1973 fue designado Asesor Especial del Secretario General de las Naciones Unidas y Subsecretario General de las Naciones Unidas para asuntos económicos y sociales y un año después se hizo cargo de las operaciones de emergencia de las Naciones Unidas a favor de los países en desarrollo que se habían visto más gravemente afectados por la crisis económica.

Desde 1976, dirige la Revista de la CEPAL. Desde la Secretaría Ejecutiva de la CEPAL, y  posteriormente, como Secretario General de la UNCTAD, el Sr. Prebisch promovió una serie de ideas que influyeron en el pensamiento y en la acción de América Latina y de los países del tercer mundo en lo relativo a sus estrategias y políticas de desarrollo económico y social. Entre estos innumerables logros, cabe destacar el haber llamado la atención de la comunidad internacional a favor a un cambio significativo  de actitudes en cuanto a las relaciones de los países desarrollados con las naciones en desarrollo, así como las modificaciones sustanciales en los esquemas tradicionales de la división internacional del trabajo.

Esta – ideas fuerzas – ejercieron influencia sobre los movimientos de integración regional y promovieron en surgimiento esquemas formales tales como el Mercado Común Centroamericano y la Asociación Latinoamericana de Libre Comercio.

Desde la UNCTAD Prebisch impulsó un proceso de negociaciones entre los países ricos y pobres, estimuló la evolución de nuevos enfoques de la diplomacia multilateral para el desarrollo.

En 1974 recibió la distinción de “Jawarharlal Nehru” que le otorgó el gobierno de la India en reconocimiento a los servicios prestados a la comunidad internacional a favor del desarrollo económico y social. En 1977, la Asociación Pro Naciones Unidas, de la República Federal de Alemania, le concedió la medalla “Dag Hammarskjold” por sus contribuciones a la causa de la paz y el desarrollo.

El 2 de abril de 1981, el Dr. Prebisch recibió el premio Tercer Mundo por la Fundación Tercer Mundo, con sede en Londres, Reino Unido, para distinguir los esfuerzos de personas o instituciones que se hayan destacado por contribuciones sobresalientes los países en desarrollo, particularmente en los aspectos económicos, sociales,  políticos y científicos.